Sinopsis Murid SMA yang kesepian, Yukiteru Amano, menghabiskan hari-harinya dengan menulis buku harian di ponselnya, sambil bercakap-cakap dengan dua temannya yang tampaknya imajiner Deus Ex Machina, yang merupakan dewa ruang dan waktu, dan Murmur, hamba dewa. Mengungkap dirinya sebagai dewa yang sebenarnya, Deus memberi Yukiteru sebuah "Buku Harian Acak," yang menunjukkan entri yang sangat deskriptif berdasarkan masa depan dan memaksanya ke dalam pertempuran berdarah dengan 11 pemegan…